指纹识别的原理如下：
①集取（capture）：首先利用指纹扫描器，将指纹的图形及其他相关特征集取下来。
②演算（algorithm）：将图形及相关特征，运用程式运算及统计，找出该指纹具有所谓“人人不同且终身不变的特性”的相关特征点，并将之数位化，该数位化之数据自然仍 具有指纹人人不同且终身不变的特性。
③传送（transmit）：将数位化的指纹特征在电脑上运用各种方式传送，不论其传送方式 或加解密方式，均仍保留该特有的特性。
④验证（verify）：传送过来的数据再经程式运算、验证其与资料库中的比对资料的相似程度，达到一定程度以上的统计相似度，因其差异在某种极低的机率以下，即可代表这是由本人传送过来的指纹数据。故只要符合上述原理，中间无任何种转换上的漏失，且在一定的比对值以上，均可确认是本人的指纹。